司法書士に頼まなくても、抵当権の登記の抹消はできますか。

司法書士に頼まなくてももちろんできます。
例えば、弁護士に頼まなくてもご本人で訴訟を起こすことはできますし、税理士に頼まなくても確定申告ができることと同じです。

ただ、司法書士も弁護士も税理士もそれぞれ法的手続の専門家ですから、このような法律専門家が携わる手続は、専門的で難しいことが多いといえます。
それぞれの専門家に頼むと、当然に費用が掛かるというデメリットはありますが、専門家に頼んだほうが、安全・確実・迅速などメリットも大きいといえます。

抵当権の登記の抹消手続ですが、不動産登記手続の中では比較的簡単ですので、知り合いの司法書士もしくは最寄りの法務局に教えてもらえば個人の方でもできるお手続といえます。